郭康认为，对于教会来说，就有个关键问题：教会内的各种教义、规则，到底是目标，还是手段。

曾经，公教教会面对这个问题，思路是十分清晰的，知道这些具体措施都是为了更高的目的。然而到了后来，他们却好像集体出了问题一样。

如果只是党争，反而好解释，但教会几百年间在东亚的表现，都一直处于智力没上线的状态。

如果说教士们是因为对不同文明的傲慢，那就没法解释在其他地方的表现了。当年在南美洲，教会反而不是这样。

西班牙的教士常年致力于反对迫害美洲土著，要求禁止屠杀、虐待的行为，甚至反对强迫土著人改宗。在道明会修士们的推动下，1537年，教宗颁布通谕，正式确认印第安是“理性人”，宣布他们有自由和财产权，也有皈依教会的权力，应当以和平的方式向他们进行宣讲。

在此基础上，教士们继续在世俗政权中活动，试图阻止殖民者对于当地人的剥削和奴役。在他们的推动下，1550年，查理五世下令停止西班牙人在美洲的进一步军事扩张，同时组织教士和学者进行辩论，探讨征服的合法性。辩论在巴利亚多利德大学举行，因此也被以这个名称命名。

巴利亚多利德辩论是欧洲历史上，第一次关于土著人权利和待遇的讨论，也是少有的国家层面的理论探讨。