因为高拱把自己定位为隆庆帝的第一忠臣，所以他认为徐阶这么做，不光是自私，而且还是在刻意打压和蔑视新君的威严——我父皇这辈子尽干错事，我这个新君能有面子到哪去？

徐、高之间的矛盾当然并不只有这么一点，随便再举两个例子：在新帝登基后的赏军大典上，高拱再一次与徐阶出现政见分歧。原本新皇登基之时赏赐军方并非什么祖制，而是从正统元年开始的惯例。嘉靖帝即位时因为国库殷实，便将原定的赏赐又翻了一倍。

隆庆登基，徐阶打算按照嘉靖登基时的标准去办，高拱立刻表示反对，道：“现在的国库空乏，承受不起这项消耗。不如按照正统时的标准行事，那么就可以省下一半的钱，只要花二百万就够了。”

而徐阶直接拒绝了高拱的建议。因为徐阶知道，对于下面的人，赏赐总是多多益善的，无论出于什么理由减少赏赐，都会得罪人。以徐阶的精明，当然不会做这种有害于己的傻事，毕竟赏赐花的钱又不用他徐阁老出。结果高拱力争而不果，最终，赏赐沿袭嘉靖登基的标准发出，而户部则为此困苦不支。

又譬如有一次廷议，众言官为了该不该拟去一个大臣的问题争执不下，双方吵得就差上演全武行。徐阶一看这局面不好把控，又不愿意开罪言官的任何一方，就打算把问题推给皇帝，让皇帝决定该大臣的去留。

高拱当场质疑徐阶不负责任的行为，发出异议：“不能开这个‘恭请圣裁’的先例。在先朝遇事不决请上裁，是因为先帝经久执政，通达国体；而今上即位这才几天，怎么可能知道群臣谁贤谁不肖？让皇上自己裁定，皇上却该如何判断？恐怕只能询问身边的人。长此以往，天下大事就可能会被宵小劫持了。”

徐阶立刻黑了脸，认为高拱纯粹无理取闹，凡事非要与自己对着干才高兴。在言官们的支持下，徐阶再一次胜利，最终还是请了“上裁”。而高拱和徐阶的矛盾，也更加地公开化，朝廷上下无人不晓。由于徐阶的威望和影响力，再加上他不得罪人，而高拱则一门心思维护自己皇帝学生的，因此舆论都倾向于指责高拱擅权，破坏内阁秩序。

像这样的矛盾在高拱当初第一次入阁的近一年时间里，在徐、高二人之间几乎不间断地上演。只是由于新朝初始的不稳定状态，使得这些事情所牵动的气氛愈发微妙。时人黄景昉有评论说：“高拱任怨，徐阶专任恩，二者的倾轧皆由此而起。”该评价可谓中肯。